La population autochtone (Premières nations, Inuits, Métis) aujourd'hui estimée en plus d'un million et demi de gens (5% de la population du Canada) elle a été objet de formes différentes d'apartheid soit pendant la période coloniale qui après l'indépendance. Les écoles résidentielles indiennes sont l'exemple plus eclatante de l'apartheid développé dans les colonies canadiennes du Royaume-Uni et après 1931 directement par le Gouvernement fédéral pour assimiler la population autochtone à la culture dominante.

Le 10 mai 2006 le Gouvernement canadien a annoncé l'approbation de la Convention de résolution relative aux écoles résidentielles indiennes, qui est entrée en vigueur le 19 septembre 2007 en prévoyant des dédommagement et des services d'assistance sociale aux victimes, l'activation d'une Commission vérité et réconciliation, un programme de commémorations et d'initiatives de réconciliation.

Le 11 juin 2008 le premier ministre Stephen Harper a ensuite exprimé au nom du Gouvernement les éxcuses à la population native pour le rôle du Canada dans le système des écoles résidentielles indiennes. Malgré les excuses présentées par le Premier ministre Stephen Harper, le dédommagement moyen aux anciens élèves encore en vie a été limité à environ 20 mille dollars, son obtention a déterminé l'impossibilité  d'agir en tribunal dans les cas d'agressions physiques ou sexuelles et la Commission vérité et réconciliation s'est adressée à la magistrature pour obtenir des administrations fédérales toute la documentation en leur possession.

Pendant le 2012 le Gouvernement fédéral a ensuite rénové l'attaque aux droits des autochtones avec la loi C-38, approuvée par le Parlement canadien le 29 juin 2012, et avec la loi C-45, approuvé par le Parlement canadien le 14 décembre 2012, que, en ouverte violation des Traités, elles facilitent l'appropriation des terres des réserves pour l'exploitation des abondantes ressources pétrolifères avec des conséquences désastreuses du point de vue de l'environnement.

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